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Comment puis-je parler à UniProt via HTTP en Python?

J'essaie d'obtenir des résultats d'UniProt, qui est une base de données de protéines (les détails ne sont pas importants). J'essaie d'utiliser un script qui traduit d'un type d'ID à l'autre. J'étais c

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Comment changer cela en "idiomatique" Perl?

Je commence à approfondir Perl, mais j'ai du mal à écrire du code "Perl-ly" au lieu d'écrire C en Perl. Comment puis-je changer le code suivant pour utiliser plus d'idiomes Perl, et comment devrais-je

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Exécution BLAST requêtes avec biopython

Je voudrais BLAST plusieurs séquences Récupérez les 100 meilleurs coups ou si de chaque requête Piscine les séquences téléchargées Supprimer les doublons Comment puis-je faire cela dans BioPython?

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Techniques de récursivité Perl?

J'ai besoin d'un peu d'aide avec ce code. Je connais les sections qui devraient être récursives, ou du moins je pense que je le fais, mais je ne suis pas sûr de la façon de l'appliquer. J'essaie de me

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R paquet statistique: emballage des objets GOFrame

J'essaie de générer des objets GOFrame pour générer une cartographie d'ontologie génique dans R pour les organismes non supportés (voir http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/GOst

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Calcul de séquences d'ADN

Pourriez-vous me dire comment je peux calculer les séquences d'ADN en Java en utilisant l'algorithme de Levenshtein

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Comment puis-je trouver plusieurs motifs (sous-chaîne) dans une séquence de protéines (chaîne)?

Le script suivant sert à trouver un motif dans une séquence protéique. use strict; use warnings; my @file_data=(); my $protein_seq=''; my $h= '[VLIM]'; my $s= '[AG]'; my $x= '[ARNDCEQGHILKMFPST

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Personnalisation de la sortie de BLAST?

Je sais que cela est une question très précise concernant BLAST et bio-informatique, mais va ici: Je cherche à utiliser BLAST autonome (j'ai déjà téléchargé et testé en cours d'exécution sur la ligne

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Évaluation de la signification d'un score BLASTn?

Je lance une ligne de commande autonome pour aligner de nombreuses séquences de requêtes sur une grande base de données de nucléotides. Je peux modifier les paramètres de la ligne de commande du progr

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évaluation rapide des fichiers CEL Affymetrix corrompu

Je suis en train de normaliser une grande quantité de fichiers CEL Affymetrix en utilisant R. Cependant, certains d'entre eux semblent être tronqués, donc en les lisant je reçois l'erreur Cel file xxx