biopython

0La chaleur

2Répondre

Exécution BLAST requêtes avec biopython

Je voudrais BLAST plusieurs séquences Récupérez les 100 meilleurs coups ou si de chaque requête Piscine les séquences téléchargées Supprimer les doublons Comment puis-je faire cela dans BioPython?

bioinformatics biopython sequences blast 2009-11-03

---

0La chaleur

2Répondre

Imprimer 50 séquences de chaque ligne à l'aide de Clustal

J'ai un fichier d'alignement de séquence multiple (Clustal) et je veux lire ce fichier et organiser les séquences de manière à ce qu'elles soient plus claires et précises dans l'ordre. Je fais cela à

parsing biopython clustal 2010-05-22

---

3La chaleur

2Répondre

BioPython: extraction des ID de séquence à partir d'un fichier de sortie Blast

J'ai un fichier de sortie BLAST au format XML. Il s'agit de 22 séquences de requêtes avec 50 occurrences de chaque séquence. Et je veux extraire tous les hits 50x22. C'est le code que j'ai actuellemen

python xml-parsing biopython xmlblaster 2009-11-05

---

6La chaleur

1Répondre

Phylo BioPython arbres de construction

Je tente de construire un arbre avec BioPython, module Phylo. Ce que je l'ai fait jusqu'à présent est cette image: chaque nom a un numéro à quatre chiffres suivi - et un numéro: ce numéro se réfèrent

python numpy graphviz biopython 2010-10-29

---