bioconductor

1La chaleur

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Dans R, comment définir une classe S4 basée sur la classe d'un autre objet

Je dois créer un objet de type ShortReadQ à partir de la bibliothèque ShortRead de Bioconductor. ShortReadQ 'signature(sread = "DNAStringSet", quality = "QualityScore", id = "BStringSet")' La

r s4 bioconductor 2010-03-01

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8La chaleur

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R + Bioconductor: combiner des probesets dans un ExpressionSet

Tout d'abord, cela peut être le mauvais forum pour cette question, car il est sacrément R + Bioconducteur spécifique. Voici ce que j'ai: library('GEOquery') GDS = getGEO('GDS785') cd4T = GDS2eSet(GD

r bioconductor 2010-05-05

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1La chaleur

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R paquet statistique: emballage des objets GOFrame

J'essaie de générer des objets GOFrame pour générer une cartographie d'ontologie génique dans R pour les organismes non supportés (voir http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/GOst

r statistics bioinformatics bioconductor 2009-11-12

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3La chaleur

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Installation d'un paquet local qui n'est pas un .tar.gz

Je travaille sur un script qui crée un paquet dans le répertoire courant (en utilisant pdInfoBuilder de BioConductor), et je voudrais l'installer pendant que le script est en cours d'exécution. instal

r bioconductor 2009-10-06

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