bioinformatics

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sous-classe/classe enfant

j'avais cette classe et sous-classe: classe Gamme: def __init__(self, start, end): self.setStart(start) self.setEnd(end) def getStart(self): return self.start def setStart(self, s):

python bioinformatics 2010-10-17

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Comment utiliser d'autres méthodes de clustering pour clustergram dans la boîte à outils bioinformatique de Matlab

EDIT: J'ai compris. Je ne comprenais pas la notation. Bonjour, Espérons que quelqu'un là-bas est familier avec la clustergram dans la boîte à outils de bio-informatique. Je m'intéresse aux aspects gra

oop matlab bioinformatics hierarchical-clustering 2010-10-20

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Quelle est la meilleure plate-forme de cloud computing pour biopython?

Je travaille actuellement (comme projet principal) la construction et la mise en œuvre d'une application web de bio-informatique pour manipuler des données volumineuses & certains des travaux complexe

python cloud bioinformatics 2010-12-09

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R: ape/phylobase: impossible de convertir l'arbre binaire ultramétrique en objet hclust (message d'avertissement)

J'ai importé une arborescence ClustalW2 dans R en utilisant la fonction ape et la fonction read.tree du paquet ape. J'estime les âges moléculaires en utilisant la fonction chronoplasique, résultant en

r bioinformatics ape-phylo 2010-12-13

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bases de données blastn Obtention programatically

Dans le Nucleotide BLAST search page est-il un moyen d'obtenir les bases de données répertoriées programatically dans la case « Choisissez Recherche Set »? Peut-être en format XML? Je ne pense pas (pe

bioinformatics blast 2010-09-14

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Utilisation de create awk deux tableaux à partir de deux valeurs de la colonne, trouver différence et les différences somme, et les données de sortie

j'ai un fichier avec les champs suivants (et une valeur d'exemple à droite): hg18.ensGene.bin 0 hg18.ensGene.name ENST00000371026 hg18.ensGene.chrom chr1 hg18.ensGene.strand - hg18.ensGene.txStart

bash csv awk bioinformatics 2010-09-15

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combiner deux listes avec une jointure sur une colonne

J'essaie de combiner deux listes, les rejoignant par un champ commun tel que ENST00000371026. J'ai essayé le suivant mais pas de chance. Quelle est la manière réelle de le faire? cat> gar1.txt <<EOF

bash join bioinformatics 2010-09-16

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MongoDB: Quel est le moyen le plus efficace pour stocker un chromosome/position

Je veux stocker quelques positions génomiques (chromosome, position) en utilisant MongoDB. quelque chose comme: { chrom:"chr2", position:100, name:"rs25" } Je veux être en mesure de trouver rapi

mongodb indexing position bioinformatics database 2010-09-18

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Modification de l'aide avec le script Perl pour démarrer et arrêter à des endroits spécifiques dans un tableau

Vous recherchez une aide pour le dépannage et la modification. Ceci est un devoir. Mon professeur encourage l'utilisation des forums. Je n'ai pas encore d'expérience avec Perl Functions ou Subs, alors

perl hashmap bioinformatics perl-data-structures bioperl 2010-11-09

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Calcul/stockage CDF empirique efficace

J'essaye de précalculer les distributions de plusieurs variables aléatoires. En particulier, ces variables aléatoires sont les résultats de fonctions évaluées à des emplacements dans un génome, de sor

python optimization statistics bioinformatics 2010-11-23

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