dna-sequence

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Comment (et où) obtenir des séquences d'ARNt alignées (et l'importer dans R)

Je souhaite (pour mon travail de thèse), importer des données d'ARNt dans R et l'aligner. Mes questions sont les suivantes: Quelles ressources puis-je utiliser pour les données? Quelles commandes pour

r dataset bioinformatics dna-sequence 2010-03-11

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2La chaleur

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Comparer plusieurs sous-chaînes

Je tente d'écrire un séquenceur d'ADN de base. Dans ce, compte tenu de deux séquences de la même longueur, il sortie les chaînes qui sont les mêmes, avec une longueur minimale de 3. donc entrée abcdef

java substring dna-sequence 2010-09-29

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1La chaleur

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Sous-séquences récurrentes et compression

J'aimerais faire une sorte d'algorithme de "recherche et remplacement" qui, de manière efficace si possible, identifie une sous-chaîne d'une chaîne qui survient plus d'une fois et remplace toutes les

string compression dna-sequence 2010-06-28

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6La chaleur

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Génération ADN synthétique Séquence avec Subtitution taux

Compte tenu de ces entrées: my $init_seq = "AAAAAAAAAA" #length 10 bp my $sub_rate = 0.003; my $nof_tags = 1000; my @dna = qw(A C G T); Je veux générer: Mille longueur-10 balises Taux de substitu

perl algorithm bioinformatics dna-sequence 2009-03-02

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1La chaleur

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Techniques de récursivité Perl?

J'ai besoin d'un peu d'aide avec ce code. Je connais les sections qui devraient être récursives, ou du moins je pense que je le fais, mais je ne suis pas sûr de la façon de l'appliquer. J'essaie de me

perl algorithm alignment bioinformatics dna-sequence 2009-09-18

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