DICOM de base pour les données volumétriques

J'ai regardé certaines des normes DICOM et la page Wikipedia (et tous les sujets DICOM sur SO) mais sans vraiment creuser dans la structure de fichier doc (pouah), je suis confus ce que exactement est stocké dans un fichier DICOM pour un balayage comprenant des données 3D/4D/5D. Je veux seulement un aperçu.DICOM de base pour les données volumétriques

Prenons l'IRM à titre d'exemple. Est-ce que le fichier DICOM contient

un ensemble des images 2D premières prises sous différents angles
une pile de tranches formant un ensemble de données de voxel 3D
un plein jeu de données 3D

En d'autres termes , est-ce que DICOM inclut post-traitement sur les images brutes capturées par la machine d'imagerie?

En ce qui concerne 4D, il ne s'agit probablement que d'une collection de plusieurs jeux de données 3D, chaque «trame» est un ensemble de données distinct?

Source

2010-12-13 Mr. Boy

La "norme" DICOM a tellement d'options différentes, avec des extensions de fournisseur, que la plupart des choses sont possibles. Cela dit, la plupart des jeux de données 3D DICOM que j'ai rencontrés sont des piles d'images 2D. Pour le post-traitement, cela dépend uniquement de la machine d'imagerie.

Si vous cherchez une bibliothèque DICOM disponible gratuitement, vous pouvez essayer GDCM, j'en ai été plutôt satisfait.

Source

2010-12-13 17:30:08 tkerwin

+1 oui, c'est presque, mais pas tout à fait, contrairement à un standard. –

GDCM est celui que j'ai regardé, mais j'étais un peu perdu ce qu'il fait et ne supporte pas. Donc, en substance, je peux généralement attendre une collection d'images JPG individuelles? –

Fondamentalement, oui.Le problème est qu'il y a souvent plusieurs piles jetées dans le même répertoire avec des noms de fichiers inutiles. Vous devez utiliser les étiquettes (séries, position de l'image, etc.) pour savoir ce qui va où. – tkerwin

Le format DICOM MR original contient une seule image 2D. Ce format est encore largement supporté, très probablement ce que vous avez. Si ce est ce que vous avez, alors vous aurez envie de rassembler toutes les images d'une série pour construire votre volume.

Un format d'image MR amélioré et plus récent est capable de stocker un volume entier en tant qu'image multi-image. Si c'est le cas, c'est votre volume. Je ne me souviens pas si un seul objet MR amélioré doit être la totalité de la série ou non.

Vous pouvez les différencier en regardant l'UID SOP attribut DICOM classe (0008,0016):

Original MR: 1.2.840.10008.5.1.4.1.1.4 
Enhanced MR: 1.2.840.10008.5.1.4.1.1.4.1

Au-dessus, quand je dit que vous pourriez avoir besoin de recueillir « toutes les images dans une série Pour créer un volume, cela signifie que vous utilisez les images partageant la même valeur pour l'attribut UID d'instance de série (0020 000E).

Notes:

puristes DICOM préféreront le terme « Information sur l'image objet Définition » au lieu du mot « format » comme je l'ai utilisé.
Les puristes DICOM s'opposeront à ce que l'UID de classe SOP définisse le format de l'image. Pour vos besoins, cela fonctionnera.

Source

2011-04-19 21:56:41

DICOM de base pour les données volumétriques

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