Problèmes de symboles non définis lors de l'utilisation de l'espace de noms OpenMS

Question

J'essaie d'obtenir un exemple de code pour travailler avec bonheur avec OpenMS et rencontrer beaucoup de problèmes. J'ai (juste un petit programme échantillon fourni à titre d'exemple):

#include <OpenMS/FILTERING/SMOOTHING/GaussFilter.h> 
#include <OpenMS/FORMAT/MzMLFile.h> 
#include <OpenMS/KERNEL/StandardTypes.h> 
#include <stdio.h> 

using namespace OpenMS; 
using namespace std; 

Int main(){ 
    PeakMap exp; 

    MzMLFile mzdata_file; 
    mzdata_file.load("../sampledata_Centroidmode.mzML",exp); 

    GaussFilter g; 
    Param param; 
    param.setValue("gaussian_width",1.0); 
    g.setParameters(param); 

    g.filterExperiment(exp); 

    return 0; 
} 

Et je le compiler:

g++ -Wall -IOpenMS-1.7.0/include -IOpenMS-1.7.0/contrib/include -I/Library/Frameworks/QtCore.framework/Headers -arch i386 scratch.cpp 

Il arrive avec un bateau plein d'erreurs (environ ~ 500Kb d'entre eux, en fait). Le problème semble résider dans "using namespace OpenMS;" Un petit échantillon des erreurs:

Undefined symbols: 
    "OpenMS::DataValue::DataValue(int)", referenced from: 
     OpenMS::Internal::MzMLHandler<OpenMS::MSExperiment<OpenMS::Peak1D, OpenMS::ChromatogramPeak> >::handleUserParam_(OpenMS::String const&, OpenMS::String const&, OpenMS::String const&, OpenMS::String const&, OpenMS::String const&)in cc7cSzjW.o 
    "OpenMS::DataValue::DataValue()", referenced from: 
     OpenMS::Internal::MzMLHandler<OpenMS::MSExperiment<OpenMS::Peak1D, OpenMS::ChromatogramPeak> >::handleUserParam_(OpenMS::String const&, OpenMS::String const&, OpenMS::String const&, OpenMS::String const&, OpenMS::String const&)in cc7cSzjW.o 
    "OpenMS::SourceFile::operator!=(OpenMS::SourceFile const&) const", referenced from: 
     OpenMS::Internal::MzMLHandler<OpenMS::MSExperiment<OpenMS::Peak1D, OpenMS::ChromatogramPeak> >::writeTo(std::basic_ostream<char, std::char_traits<char> >&)in cc7cSzjW.o 
     OpenMS::Internal::MzMLHandler<OpenMS::MSExperiment<OpenMS::Peak1D, OpenMS::ChromatogramPeak> >::writeTo(std::basic_ostream<char, std::char_traits<char> >&)in cc7cSzjW.o 
     OpenMS::Internal::MzMLHandler<OpenMS::MSExperiment<OpenMS::Peak1D, OpenMS::ChromatogramPeak> >::writeTo(std::basic_ostream<char, std::char_traits<char> >&)in cc7cSzjW.o 

...

ld: symbol(s) not found 
collect2: ld returned 1 exit status 

Quelqu'un at-il aperçu de ce que je ne suis pas en train de faire?

Answer 1

Essayez de le compiler dans un fichier objet (-c) et de voir si les problèmes se produisent toujours. Exemple: s'agit-il d'un numéro de compilation ou d'un numéro de liaison ?

Aussi: Faut-il un -L drapeau pour rechercher un chemin bibliothèque particulier? Devrait-il y avoir un drapeau -l pour lier dans une bibliothèque particulière?