2009-09-08 5 views
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Comment graver des tables html à l'aide du package XML? Prenez, par exemple, cette page wikipédia sur le Brazilian soccer teamGrattage des tables html dans les trames de données R à l'aide du package XML

Je voudrais le lire en R et obtenir la "liste de tous les matches que le Brésil a joués contre des équipes reconnues par la FIFA" comme un data.frame. Comment puis-je faire ceci?

+9

Pour trouver les sélecteurs de xpath, consultez selectorgadget.com/ - c'est génial – hadley

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... ou d'essayer plus court:

library(XML) 
library(RCurl) 
library(rlist) 
theurl <- getURL("https://en.wikipedia.org/wiki/Brazil_national_football_team",.opts = list(ssl.verifypeer = FALSE)) 
tables <- readHTMLTable(theurl) 
tables <- list.clean(tables, fun = is.null, recursive = FALSE) 
n.rows <- unlist(lapply(tables, function(t) dim(t)[1])) 

la table choisi est la plus longue sur la page

tables[[which.max(n.rows)]] 
+0

L'aide readHTMLTable fournit également un exemple de lecture d'une table de texte brut d'un élément HTML PRE en utilisant htmlParse(), getNodeSet(), textConnection() et read.table() –

46
library(RCurl) 
library(XML) 

# Download page using RCurl 
# You may need to set proxy details, etc., in the call to getURL 
theurl <- "http://en.wikipedia.org/wiki/Brazil_national_football_team" 
webpage <- getURL(theurl) 
# Process escape characters 
webpage <- readLines(tc <- textConnection(webpage)); close(tc) 

# Parse the html tree, ignoring errors on the page 
pagetree <- htmlTreeParse(webpage, error=function(...){}) 

# Navigate your way through the tree. It may be possible to do this more efficiently using getNodeSet 
body <- pagetree$children$html$children$body 
divbodyContent <- body$children$div$children[[1]]$children$div$children[[4]] 
tables <- divbodyContent$children[names(divbodyContent)=="table"] 

#In this case, the required table is the only one with class "wikitable sortable" 
tableclasses <- sapply(tables, function(x) x$attributes["class"]) 
thetable <- tables[which(tableclasses=="wikitable sortable")]$table 

#Get columns headers 
headers <- thetable$children[[1]]$children 
columnnames <- unname(sapply(headers, function(x) x$children$text$value)) 

# Get rows from table 
content <- c() 
for(i in 2:length(thetable$children)) 
{ 
    tablerow <- thetable$children[[i]]$children 
    opponent <- tablerow[[1]]$children[[2]]$children$text$value 
    others <- unname(sapply(tablerow[-1], function(x) x$children$text$value)) 
    content <- rbind(content, c(opponent, others)) 
} 

# Convert to data frame 
colnames(content) <- columnnames 
as.data.frame(content) 

Edité à ajouter:

Exemple de sortie

     Opponent Played Won Drawn Lost Goals for Goals against  % Won 
    1    Argentina  94 36 24 34  148   150 38.3% 
    2    Paraguay  72 44 17 11  160   61 61.1% 
    3     Uruguay  72 33 19 20  127   93 45.8% 
    ... 
+7

Pour tous ceux qui ont la chance de trouver ce post, ce script ne sera probablement pas exécuté à moins que l'utilisateur ajoute leurs informations "User-Agent", comme décrit dans cet autre message utile: http://stackoverflow.com/questions/9056705/setting-an-informative-user-agent-string-in-geturl – Rguy

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Une autre option à l'aide XPath.

library(RCurl) 
library(XML) 

theurl <- "http://en.wikipedia.org/wiki/Brazil_national_football_team" 
webpage <- getURL(theurl) 
webpage <- readLines(tc <- textConnection(webpage)); close(tc) 

pagetree <- htmlTreeParse(webpage, error=function(...){}, useInternalNodes = TRUE) 

# Extract table header and contents 
tablehead <- xpathSApply(pagetree, "//*/table[@class='wikitable sortable']/tr/th", xmlValue) 
results <- xpathSApply(pagetree, "//*/table[@class='wikitable sortable']/tr/td", xmlValue) 

# Convert character vector to dataframe 
content <- as.data.frame(matrix(results, ncol = 8, byrow = TRUE)) 

# Clean up the results 
content[,1] <- gsub(" ", "", content[,1]) 
tablehead <- gsub(" ", "", tablehead) 
names(content) <- tablehead 

produit ce résultat

> head(content) 
    Opponent Played Won Drawn Lost Goals for Goals against % Won 
1 Argentina  94 36 24 34  148   150 38.3% 
2 Paraguay  72 44 17 11  160   61 61.1% 
3 Uruguay  72 33 19 20  127   93 45.8% 
4  Chile  64 45 12 7  147   53 70.3% 
5  Peru  39 27  9 3  83   27 69.2% 
6 Mexico  36 21  6 9  69   34 58.3% 
+0

Excellent appel à l'aide de xpath. Point secondaire: vous pouvez légèrement simplifier l'argument du chemin en changeant // */à //, par ex. "// table [@ class =" wikitable sortable "]/tr/th" –

+0

Je reçois une erreur "Les scripts doivent utiliser une chaîne informative User-Agent avec les informations de contact, ou ils peuvent être bloqués par IP sans préavis." [2] "Existe-t-il un moyen d'implémenter cette méthode? – pssguy

+2

options (RCurlOptions = liste (useragent =" zzzz ")) .Voir aussi http://www.omegahat.org/RCurl/FAQ.html section" Runtime "pour d'autres alternatives et discussion – learnr

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Le rvest le long avec xml2 est un autre paquet populaire pour l'analyse htm l pages Web.

library(rvest) 
theurl <- "http://en.wikipedia.org/wiki/Brazil_national_football_team" 
file<-read_html(theurl) 
tables<-html_nodes(file, "table") 
table1 <- html_table(tables[4], fill = TRUE) 

La syntaxe est plus facile à utiliser que le package xml et pour la plupart page ou code xml web fournit toutes les options ones besoins.

+0

Le read_html donne moi l'erreur "'file: ///Users/grieb/Auswertungen/tetyana-snp-2016/data/snp-nexus/15/SNP%20Annotation%20Tool.html' n'existe pas dans le répertoire de travail courant ('/ Users/grieb/Auswertungen/tetyana-snp-2016/code '). " – scs