J'ai un C-code pour l'informatique parallèle écrit pour gcc, et je veux le compiler sur un cluster, qui utilise apparemment icc via mpicc. Corriger le code icc -friendly semble être trop exigeant, donc je me demande si je peux demander OpenMPI à utiliser gcc à la place. Je n'ai pas les droits d'administrateur sur ce cluster, et je préférerais ne pas gâcher la configuration d'origine.Comment forcer OpenMPI à utiliser GCC au lieu de ICC? La recompilation d'OpenMPI est-elle nécessaire?
S'il n'est pas possible de définir, par ex. Makefile, alors je pourrais compiler OpenMPI dans mon répertoire personnel, mais j'ai besoin de conseils sur ce qui doit être fait après cela. Pourriez-vous m'aider?
Update1
Le Makefile contient
CC = mpicc
CFLAGS += -DMPI
Et voici quelques fichiers OpenMPI
$ which mpicc
/usr/bin/mpicc
lrwxr-xr-x /usr/bin/mpicc -> opal_wrapper
-rwxr-xr-x /usr/bin/opal_wrapper
Faites-moi savoir si je peux vous fournir plus d'informations.
MAJ2
Avec le help of Jeff, j'ai pu trouver OpenMPI paramètres pour mpicc
$ more /usr/local/share/openmpi/mpicc-wrapper-data.txt
project=Open MPI
project_short=OMPI
version=1.1.4
language=C
compiler_env=CC
compiler_flags_env=CFLAGS
compiler=icc
extra_includes= openmpi
preprocessor_flags=
compiler_flags=-pthread
linker_flags=
libs=-lmpi -lorte -lopal -ldl -Wl,--export-dynamic -lnsl -lutil -ldl
required_file=
Cependant, je n'ai pas le droit de modifier ce fichier, et OPMI_CC = gcc n » t change le compilateur.
Update3
variable d'environnement CC = gcc ne permet pas
$ export CC=gcc
$ echo $CC
gcc
$ make clean $$ make
...icc:...errors
Update4
... mais export OMPI_CC=gcc ne fin allier aide (thanks to sharth). Je me souviens que une jours ce sont des choses différentes ...
Malgré que le binaire a été créé, je reçu le message suivant bye-bye
/opt/intel/fce/9.1.036/lib/libimf.so: warning: warning: feupdateenv is not implemented and will always fail
'Makefile' a' CC = mpicc' et 'CFLAGS + = -DMPI'. Sinon, je n'ai pas l'interface 'mpi'. Est-ce correct? – Andrei
@Andrei: Ce ne sont pas des variables environnementales.Vous voulez ceux-ci ainsi que la définition des variables environnementales que j'ai suggéré ci-dessus. –
OK, je vois mon erreur. Je viens d'essayer comme vous le suggérez, et c'est toujours "icc". Peut-être pouvez-vous jeter un oeil à la page proposée par Jeff? Est-ce que je fais comme il est dit? – Andrei